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張店院區藥學部是集藥品采購供應、藥事管理、臨床藥學服務、科研教學為一體的綜合性藥學技術服務部門，負責全院藥事管理、藥學學科建設發展、藥學人才培養及其他藥學技術服務工作。科室現有工作人員18人，其中：高級職稱3人，中級職稱8人，初級職稱5人；碩士研究生2人，本科16人。藥學部下設門診藥房、住院藥房、中藥房、臨床藥學室、藥庫、耗材庫五個部門，各部門根據工作職責開展工作。
門診藥房、住院藥房作為基礎藥學服務的一線藥房，分別負責全院門急診和住院患者的處方審核、藥品調劑發放以及合理用藥指導工作。
中藥房專注于中藥飲片的供應、調劑，配備了更加符合傳統中藥飲片調劑需求的藥斗柜及調劑臺，實施散裝飲片、戥秤稱量、紙袋包裝。煎藥中心配備了更加專業化的煎藥機及自動液體分包機，可以為門診患者和住院患者提供優質的中藥飲片代煎服務。
臨床藥學室，負責醫院藥品不良反應的收集、整理、評價及報表的上報；收集和更新藥學信息，并及時與臨床交流；參與處方審核、處方點評；參與院內會診、搶救和病歷討論。在以患者為中心的藥學服務理念指導下，為患者提供優質的藥學技術服務，為臨床解決用藥問題，維護安全合理的用藥環境。
藥庫、耗材庫是藥品、耗材儲存和供應的基地。承擔全院藥品和耗材的采購、儲存、保管、供應工作。有嚴格的出入庫管理和效期管理制度，工作人員定期進行風險排查，保證藥品和耗材質量。堅持正規渠道采購，嚴格執行國家物價政策，加強藥品和耗材檢驗，杜絕偽劣藥品和耗材進入醫院，為提高醫療質量和患者使用藥品、耗材的安全有效提供了有力保證。